Los objetivos principales del ISEG son:
- Llevar el conocimiento del Acontecimiento Guadalupano a cualquier lugar del mundo a través de las tecnologías de la información.
- Continuar con los estudios arqueológicos sobre los lugares significativos en el Acontecimiento Guadalupano.
- Continuar los estudios sobre los personajes involucrados en el Acontecimiento Guadalupano.
- Continuar las investigaciones del Acontecimiento Guadalupano buscando siempre la convergencia entre varias ciencias.
- Difundir y promover las virtudes y los valores humanos que se manifiestan en el Acontecimiento Guadalupano.
- Promover la expresión artística y cultural del Acontecimiento Guadalupano.